Λίγες μέρες μετά την Ε3 και την ανακοίνωση της Rare πως ετοιμάζονται νέα updates και περιεχόμενο, το διάσημο pirate simulator έλαβε την πρώτη αναβάθμιση προς σε αυτήν την κατεύθυνση.
Στο Skeleton Thrones update, η clan των Bilge Rats έρχεται για να μείνει δίνοντας την ευκαιρία στους παίχτες να ανακαλύψουν νέα quest και να σαλπάρουν για νέες περιπέτειες. Σε αντίθεση με τα υπόλοιπα clan το συγκεκριμένο δε έχει απλά ένα αριθμό quest στα οποία ο παίχτης συμμετέχει αλλά οι περιπέτειες που είναι διαθέσιμες έχουν την μορφή limited-time event και ανανεώνονται κάθε μερικές εβδομάδες.
Στο πρώτο από αυτά τα event οι παίχτες πρέπει να βρουν και να αλληλοεπιδράσουν με ξύλινους θρόνους τοποθετημένους με μαεστρία στο χάρτη ώστε να είναι δύσκολο να εντοπιστούν. Σε κάποιους από αυτούς θα πρέπει να συνεργαστούν με άλλα πληρώματα για να πραγματοποιήσουν το απαιτούμενο στόχο.
Επίσης έχει εισαχθεί νέο νόμισμα που ξοδεύεται στην εταιρία των Bilge Rats, με την ονομασία doubloons, καθώς και νέα cosmetic αντικείμενα.